船上的任务主要围绕护送沐萍郡主展开，需要先完成一系列前置任务才能触发。首先需要前往东渡口码头，遇到秦红殇后得知海鲨帮被诬陷的消息，接着五岳四龙会出现并告知他们偷了一个装有女子的箱子，但女子被点了穴道无法解开。这时需要前往忘忧谷找仙音学习兰花拂穴手，将技能练到五重以上才能为箱中女子解穴，解穴后得知她是沐萍郡主，她会请求大家护送她前往黑冢罗王处。
接下来需要返回东渡口，在大船前找到变装后的沐萍一行人。会遇到船匠汤木，他因丧子之痛拒绝提供船只。通过和附近的船工、渔民对话，可以了解到汤木遭遇船难的悲惨经历。如果队伍中有塔娅，她会帮助汤木回忆真相并解开心结，最终汤木会同意提供新船协助大家渡过黑水沟。
比如在船舱中寻找三名潜伏的忍者，他们分别藏在炮弹箱后、走廊末端的木箱旁以及仓库右上角的大缸后面。此外还能帮汤木找回七只走丢的鸡，这些鸡分布在仓库、走廊和武器库等位置，最后一只烤鸡藏在秦红殇面前的壁炉里。完成这些支线可以获得鲸息功等奖励。
在武器库还能接到帮霹雳帮众找女儿信件的任务，信会从被击败的忍者身上掉落。船上的道具收集也很丰富，包括虎啸功秘籍和各种增益物品。记得多和NPC对话，有些隐藏线索能帮助更好地理解剧情。
最后选择前往黑冢罗王处就会进入下一段剧情。整个船上任务的关键就是耐心探索每个角落，不要错过任何对话和互动机会。完成任务不仅能推进主线，还能获得实用功法和装备，为后续冒险做好准备。
